明代我國已經(jīng)開始應(yīng)用人痘接種法預(yù)防天花,直到18世紀(jì)英國勤 納發(fā)明牛痘接種后才逐步代替,成為世界醫(yī)學(xué)免疫學(xué)的先驅(qū)。公元十七至十九世紀(jì),由于傳染病的不斷流行,人們在同傳染病作斗爭的過程中,形成并發(fā)展了溫病學(xué)派。如明代吳有性認為傳染病的發(fā)生,“非風(fēng)非寒,非暑非濕,乃天地間別有一種異氣所感”,他稱之為“戾氣"。他指出“戾氣"的傳染途徑是自口鼻而入,無論體質(zhì)強弱,觸之皆病。這就突破了中醫(yī)學(xué)歷來認為的病邪是由體表進入人體的傳統(tǒng)理論,在細菌學(xué)尚未出現(xiàn)的十七世紀(jì)中葉,這無疑是一偉大創(chuàng)舉。
清代中醫(yī)溫病學(xué)說得到了很大的發(fā)展,在治療溫病(包括傳染性和非傳染性發(fā)熱性疾病)方面成就的代表人物著作有葉桂的《溫?zé)嵴摗?、薛雪的《濕熱條辨》、吳瑭的《 溫病條辨》及王士雄的《溫?zé)峤?jīng)緯》等。而且清代醫(yī)家王清任根據(jù)尸體解剖和臨床經(jīng)驗寫成《醫(yī)林改錯》,改正了古代醫(yī)書在人體解剖方面的的一些錯誤,強調(diào)了解剖知識對醫(yī)生的重要性,并發(fā)展了瘀血致病理論與治療方法。
自鴉片戰(zhàn)爭以來,隨著西醫(yī)在中國廣泛地傳播,形成中醫(yī)、西醫(yī)并存的局面。一些醫(yī)家逐漸認識到中西醫(yī)各有所長,所以試圖把兩種學(xué)術(shù)加以匯通,逐漸形成了中西醫(yī)匯通學(xué)派。其代表人物有唐宗?!吨形鲄R通醫(yī)書五種》;張錫純《醫(yī)學(xué)衷中參西錄》等。當(dāng)西方科技文化大量涌入的情況下,與此相應(yīng)的是社會和醫(yī)藥界對傳統(tǒng)的中國醫(yī)藥逐漸有了“中醫(yī)"、中藥"之稱,對現(xiàn)代西方醫(yī)藥也因此逐漸稱為“西醫(yī)”、“西藥”。
民國時期,中國處在半封建半殖民地的社會,科技發(fā)展緩慢,由于國民黨政府采取廢止中醫(yī)的政策,阻礙了中醫(yī)藥的發(fā)展,因而引發(fā)了中醫(yī)藥界的普遍抗?fàn)?。盡管困難重重,但在中醫(yī)藥學(xué)術(shù)工作者的奮發(fā)進取中,中醫(yī)藥仍然有所發(fā)展。